gephi是一款簡單實(shí)用的網(wǎng)絡(luò)分析軟件，該軟件基于JVM制作，可以幫助用戶們在各種網(wǎng)絡(luò)和復(fù)雜系統(tǒng)對數(shù)據(jù)、鏈接、社交網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分析，讓用戶們可以輕松獲取自己所需的內(nèi)容，此外軟件還可以支持Windows, Mac OS X以及Linux多個(gè)平臺(tái)。

軟件功能

1、Gephi 是一款網(wǎng)絡(luò)分析領(lǐng)域的數(shù)據(jù)可視化處理軟件，其目標(biāo)是成為 “數(shù)據(jù)可視化領(lǐng)域的 Photoshop”。

2、Gephi是一款開源的交互式的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析平臺(tái)。

3、它支持Windows, Mac OS X以及Linux等環(huán)境。主要功能包括：

4、Gephi被用于互聯(lián)網(wǎng)，生物醫(yī)學(xué)，交通網(wǎng)絡(luò)分析等各個(gè)領(lǐng)域。

5、Gephi 是一款開源免費(fèi)跨平臺(tái)基于JVM的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析軟件, 其主要用于各種網(wǎng)絡(luò)和復(fù)雜系統(tǒng)，動(dòng)態(tài)和分層圖的交互可視化與探測開源工具。

6、可用作：探索性數(shù)據(jù)分析，鏈接分析，社交網(wǎng)絡(luò)分析，生物網(wǎng)絡(luò)分析等。

7、Gephi 是一款信息數(shù)據(jù)可視化利器。

8、Gephi 可以供大學(xué)研究項(xiàng)目數(shù)據(jù)分析使用，新聞工作者，統(tǒng)計(jì)研究，微博信息研究等。

9、Gephi 是進(jìn)行社交圖譜數(shù)據(jù)可視化分析的工具，不但能處理大規(guī)模數(shù)據(jù)集并生成漂亮的可視化圖形，還能對數(shù)據(jù)進(jìn)行清洗和分類。

10、Gephi是一種非常特殊的軟件，也非常復(fù)雜，先于他人掌握Gephi將使你一騎絕塵。

操作說明

數(shù)據(jù)處理

以CSV格式文件為例：

邊文件（(edge)：前兩列為節(jié)點(diǎn)ID，另一列為相關(guān)系數(shù)。

節(jié)點(diǎn)文件(node)：一列節(jié)點(diǎn)ID，一列節(jié)點(diǎn)類型

導(dǎo)入數(shù)據(jù)

當(dāng)然你要打開Gephi?！疚募俊敬蜷_】選擇文件，在點(diǎn)擊下一步的同時(shí)注意一下每個(gè)參數(shù)的含義是不是你要表達(dá)的意思。分別導(dǎo)入節(jié)點(diǎn)文件與邊文件。

輸入第二個(gè)文件時(shí) 注意：

設(shè)置布局樣式

Gephi提供多種布局方式，一般圓形網(wǎng)絡(luò)圖選擇”Fruchterman Reingold”布局格式。點(diǎn)擊【運(yùn)行】，等布局穩(wěn)定后，點(diǎn)擊 【停止】，生成圓形布局的網(wǎng)絡(luò)圖。

網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋮?shù)計(jì)算

點(diǎn)擊【窗口-統(tǒng)計(jì)】面板，分別點(diǎn)擊 【運(yùn)行】-【關(guān)閉】當(dāng)然你也可以選擇打印、復(fù)制，保存，最終你還是要選擇關(guān)閉。進(jìn)行以下6個(gè)拓?fù)鋮?shù)的計(jì)算:平均度、網(wǎng)絡(luò)直徑、圖密度、模塊化、平均聚類系數(shù)、平均路徑長度。

注：對于無向網(wǎng)絡(luò)圖，平均度和平均加權(quán)度 數(shù)值相同。再次注意：可能會(huì)卡。

節(jié)點(diǎn)設(shè)定

點(diǎn)擊【窗口】-【外觀】-【節(jié)點(diǎn)】-大小-數(shù)值設(shè)定，選擇渲染方式為 度，設(shè)置節(jié)點(diǎn)大小的 最大尺寸和最小尺寸（此處分別為20和70），點(diǎn)擊 應(yīng)用。顏色設(shè)置也在外觀節(jié)點(diǎn)中，設(shè)置渲染方式為Modularity Class注意紅色方框里內(nèi)容，從左到右依次為：顏色、大小，標(biāo)簽顏色、標(biāo)簽尺寸。

邊設(shè)定

在【外觀】中選擇【邊】Partition 渲染方式選擇pn即我們數(shù)據(jù)中相關(guān)性標(biāo)簽；Ranking選擇【度】。如下：

預(yù)覽修飾

點(diǎn)擊預(yù)覽，修改如下圖紅色方框選項(xiàng)，在 預(yù)覽設(shè)置 面板對網(wǎng)絡(luò)圖進(jìn)行輸出前的最后修飾。

邊框?qū)挾龋涸O(shè)為0.0，不顯示節(jié)點(diǎn)邊框。

顯示標(biāo)簽：打勾，顯示節(jié)點(diǎn)標(biāo)簽。

字體：此處修改為 Times New Roman 23號 加粗

縮短標(biāo)簽：打勾，不然標(biāo)簽會(huì)過長導(dǎo)致相互覆蓋。

厚度：根據(jù)顯示需要修改邊線厚度，此處改為5。

重新調(diào)整權(quán)重：打勾，根據(jù)邊線權(quán)重顯示不同厚度。

另外的選項(xiàng)可根據(jù)需要自行調(diào)整。在之前的設(shè)置中也可以通過預(yù)覽來查看效果，一步一步調(diào)整。

圖像導(dǎo)出

Gephi 支持多種格式的輸出：SVG、PNG、PDF、gexf圖文件等。

節(jié)點(diǎn)：相同顏色是同一個(gè)門；節(jié)點(diǎn)大小表示連接度；

邊：紅色正相關(guān)，藍(lán)色負(fù)相關(guān)（spearman），粗細(xì)表示相關(guān)系數(shù)絕對值大??；

導(dǎo)出的矢量圖可用AI等圖形編輯軟件進(jìn)一步修改，圖形文件也可以用腳本來處理，圖個(gè)性化地添加圖例等。圖文件也是一種標(biāo)簽語言。

更新日志

1.修復(fù)已知bug

2.優(yōu)化操作體驗(yàn)