Discovery Studio是一個專業(yè)的化學實驗軟件，通過它可以幫助用戶創(chuàng)建分子模型式，從而可以更好的對其進行分析，適用于實驗生物學家、藥物化學家、結(jié)構生物學家、計算生物學家和計算化學家等，支持構型、靜電學、力場、模型分析、圖像分析、藥理基團、藥理學的分析，可以將復雜的化學數(shù)據(jù)可視化，導入數(shù)據(jù)就可以為你生成相關的模型。本次為你帶來的是破解版，可以免費激活使用。

軟件功能

一、基本界面和顯示模塊

1、Discovery Studio Standalone

可視化界面，是利用Discovery Studio破解版軟件進行分子設計和模擬的基礎，支持服務器-客戶端安裝在同一臺機器上的運行模式。與Pipeline Pilot Server結(jié)合在一起，提供化學/生物學數(shù)據(jù)顯示、模擬/分析、構建三維分子、展示動態(tài)變化、三維作圖及許多其它功能

2、Discovery Studio Visualizer Client

是服務器-客戶端運行模式中、客戶端的可視化界面，用于訪問和使用服務器端的軟件。必須與服務器端配置的Pipeline Pilot Server協(xié)同工作，為用戶提供無與倫比的數(shù)據(jù)、工作流程和計算資源共享

二、蛋白質(zhì)模擬模塊

1、DS MODELER

只要給出未知結(jié)構序列與另一個已知三維結(jié)構蛋白的比對，利用工業(yè)標準的快速同源模建方法，便可自動并快速產(chǎn)生優(yōu)化的蛋白同源模型。對于靶標發(fā)現(xiàn)及蛋白家族功能結(jié)構分析，MODELER是一個理想的解決方案。用MODELER還可以模擬蛋白突變，進行l(wèi)oop區(qū)模建及基于結(jié)構的比對并構建有配體結(jié)合的蛋白結(jié)構模型。結(jié)合Sequence Analysis模塊，可以全自動完成抗體Loop區(qū)模建。結(jié)合軟件里模擬及以結(jié)構為基礎的藥物設計的功能模塊，用MODELER還可以深入研究蛋白結(jié)構及功能的關系

2、DS Protein Refine

利用CHARMm對模建好的蛋白質(zhì)進行側(cè)鏈和loop區(qū)的優(yōu)化，提高蛋白質(zhì)模型的準確性

3、DS Protein Health

蛋白質(zhì)三維結(jié)構合理性評價工具。Protein Health模塊運用Profiles 3D方法，通過將三維結(jié)構的結(jié)構環(huán)境與特定氨基酸殘基的優(yōu)先外界環(huán)境相比較，獲得相關結(jié)構性質(zhì)與氨基酸序列信息之間的關系。通過Protein Health模塊的分析，用戶可以方便快速地找到蛋白質(zhì)結(jié)構中不合理的區(qū)域

4、DS Protein Families

通過分析某一蛋白家族蛋白序列的保守模式以及在三維結(jié)構上的保守殘基的位置，可以在分子水平上更好地了解到蛋白功能機制。Protein Families的簡單易用的流程(protocols)，也可一步步地引導用戶進行分析，從蛋白家族的序列或者結(jié)構比對，到進化蹤跡分析。而進化蹤跡分析包括用分層聚類的方法來建立蛋白家族系統(tǒng)樹圖以及把這些得到的功能注釋信息畫到你的三維結(jié)構上去。進行序列比對時，允許根據(jù)需要對比對結(jié)果添加約束，提高活性部位關鍵殘基的比對效果

5、DS Sequence Analysis

與功能已知的其它蛋白的序列進行比對，是確定某一蛋白生物功能的第一步。用Sequence Analysis也可以讓用戶通過通用的BLAST及PSI-BLAST算法來搜索本地數(shù)據(jù)庫或者NCBI網(wǎng)上數(shù)據(jù)庫，確定蛋白序列的同源區(qū)域。結(jié)果在交互的報告格式里面顯示以方便進行進一步的分析及在其它Discovery Studio破解版模塊里面的使用。使用Blast搜索PDB或PDB_nr95數(shù)據(jù)庫時，結(jié)果文件中可以顯示輸出蛋白質(zhì)的SCOP ID, Ligand ID以及X射線分辨率等信息

安裝方法

1、安裝的時候可以看到軟件具有32、64版本，小編的電腦是64，所以選擇DS45Client.exe

2、進入安裝提示，確認安裝信息，無誤，點擊Next進行安裝

3、用戶可有點擊Change來設置軟件安裝位置

默認安裝位置：C:\Program Files\BIOVIA\Discovery Studio 4.5\

4、提示軟件已經(jīng)可以安裝到電腦上，顯示所有安裝的提示

5、進入安裝過程，需要配置很多附加的安裝程序，等待一段時間

6、軟件安裝完成，點擊Finish退出安裝向?qū)?/p>

7、將破解補丁文件下的破解補丁復制到軟件文件中

8、雙擊打開軟件，點擊Help下的About，如下圖軟件已經(jīng)破解完成，用戶可以放心使用

使用教程

1、雙擊打開軟件，如下圖

2、進入軟件，顯示很多示例文件，這里可以點擊第一個Protein Structure蛋白質(zhì)結(jié)構查看

3、如圖所示，這里就是蛋白質(zhì)的編輯樣式，如果你需要自己設計，可以從化學界面上找到模型

4、點擊Multiple sequence alignment功能，可以將您的多序列比對

5、提示一些關于DNA的子項目，可以點擊DNA-Single Strand查看鏈接，也可以查看不同的分子樣式

6、點擊Chemistry可以查看軟件的化學結(jié)構，可以分析立體化學模型

更新日志

1、新的數(shù)據(jù)庫又得到了化學結(jié)構復制的方案

2、可以從數(shù)據(jù)庫上找到分子方程式的變量數(shù)據(jù)

3、也可以自己將實驗的結(jié)果制作為研究模板

4、也可以針對不同類型的化學元素添加

5、支持使用電解質(zhì)方程插入到模型上

6、支持對分析的化學結(jié)果添加注釋信息