Arlequin是一款數(shù)據(jù)分析工具，使用這款軟件可以針對(duì)人類遺傳學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，支持AMOVA計(jì)算、中性檢驗(yàn)、錯(cuò)配分布等功能。需要的用戶快來(lái)下載看看吧。

軟件介紹

Arlequin官方版是一款專業(yè)的人類遺傳學(xué)數(shù)據(jù)分析軟件，通過(guò)對(duì)統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)中信息的挖掘，可進(jìn)行AMOVA計(jì)算、中性檢驗(yàn)、錯(cuò)配分布等，為從事醫(yī)學(xué)和生物學(xué)研究的朋友提供了參考方案，比較遺憾的是軟件沒(méi)有漢化版，使用起來(lái)可能稍微有些吃力!

軟件功能

1、Molecular diversity(分子多態(tài)性)

2、Mismatch distribution(錯(cuò)配分布)

3、Haplotype frequency estimation(單倍型頻率估計(jì))

4、Linkage disequilibrium(連鎖不平衡：檢測(cè)不同位點(diǎn)上等位基因的非隨機(jī)關(guān)聯(lián))

5、Hardy-Weinberg equilibrium(哈溫—伯格平衡)

6、Tajima`s neutrality test(Tajima中性檢驗(yàn))

7、Fu`s neutrality test(Fu中性檢驗(yàn))

8、Ewens-watterson neutrality test(Ewens-watterson中性檢驗(yàn))

以上三個(gè)中性檢驗(yàn)都是基于無(wú)限位點(diǎn)模型，適用于DNA sequence 和 RFLP單倍型。

9、Chakraborty`s amalgamation test (Chakraborty`s 融合檢驗(yàn)，檢測(cè)人群的均一性或同質(zhì)性和中性選擇等)

10、Minimu Spanning Network(MSN，最小擴(kuò)張樹(shù)或稱之為最小支撐樹(shù),，基于分子差異)

11、AMOVA 分子差異度分析，用以評(píng)測(cè)人群的遺傳結(jié)構(gòu)

12、Pairwise genetic distances (遺傳距離的估計(jì))

13、Exact test of population differentiation (檢測(cè)隨機(jī)交配群體單倍型的非隨機(jī)分布)

14、Assignment test of genotype (通過(guò)估計(jì)等位基因頻率將單個(gè)基因型分配到特定的人群中)