Geneious Prime是專業(yè)的分子生物學(xué)和序列分析工具,從事相關(guān)行業(yè)的用戶就會需要用到它,本次給大家?guī)淼氖亲钚碌?021破解版,激活后就可以免費(fèi)使用。下面還有這詳細(xì)的安裝破解教程。軟件提供了全面的生物信息學(xué)分析工具,支持序列比對、序列觀看、PCR引物設(shè)計(jì)等多種功能,還可以模擬各個(gè)步驟的分子克隆操作。不管是生物制藥、生命科學(xué)還是學(xué)術(shù)研究都會用到它。
安裝方法
1、首先從本站下載數(shù)據(jù)包然后解壓,得到安裝程序“Geneious_Prime_win64_with_jre.msi”,鼠標(biāo)雙擊運(yùn)行進(jìn)入安裝向?qū)c(diǎn)擊“next”進(jìn)入下一步
2、選擇第一項(xiàng)“I accept the terms of the license agreement”(我接受許可協(xié)議的條款),再點(diǎn)擊“next”進(jìn)入下一步|
3、選擇安裝位置,默認(rèn)路徑為“C:\Program Files\Geneious Prime\”,建議最好不要安裝到系統(tǒng)盤(C盤)
4、勾選“create a dessktop icon”(創(chuàng)建一個(gè)桌面圖標(biāo))
5、軟件安裝需要一些時(shí)間請耐心等待即可
6、當(dāng)安裝完成后點(diǎn)擊“finish”即可退出安裝向?qū)?/p>
7、安裝完成后先不要運(yùn)行,回到剛才下載的數(shù)據(jù)包中將破解補(bǔ)丁復(fù)制道軟件的安裝目錄中替換原文件即可
8、最后軟件軟件即可開始免費(fèi)使用,破解完成
軟件特色
1、NGS預(yù)處理
導(dǎo)入Illumina,PacBio和NanoPore讀取
修剪,過濾和解復(fù)用單端和成對端數(shù)據(jù)
合并配對的讀
重復(fù)數(shù)據(jù)刪除
錯誤糾正和規(guī)范化
濾除嵌合體
學(xué)到更多
2、制圖和重新組裝
只需在業(yè)界領(lǐng)先的制圖算法和從頭組裝算法之間切換
支持匯編Sanger和NGS數(shù)據(jù),包括任何長度的Illumina,PacBio和Oxford納米孔讀取,包括雙端讀取和混合裝配
組裝微生物基因組,質(zhì)粒和其他環(huán)狀序列時(shí)產(chǎn)生環(huán)狀重疊群
基因組比較和MAUVE基因組比對結(jié)束
映射程序包括BBMap,Minimap2,Bowtie2和TopHat
從頭組裝算法,包括SPAdes,F(xiàn)lye,MIRA,Tadpole和Velvet
3、變體調(diào)用和表達(dá)分析
使用FreeBayes調(diào)用SNP /變體
使用同步的基因組視圖對表格結(jié)果進(jìn)行實(shí)時(shí)過濾
在映射的RNA-seq數(shù)據(jù)上計(jì)算和比較表達(dá)水平
使用PCA和火山圖進(jìn)行可視化
4、序列分析
修剪,組裝和查看Sanger測序跟蹤文件
更正基礎(chǔ)調(diào)用并創(chuàng)建共識序列
注釋主題,ORF和重復(fù)
預(yù)測基因和結(jié)構(gòu)元素
通過針對數(shù)據(jù)庫的相似性搜索進(jìn)行實(shí)時(shí)注釋
快速翻譯選擇內(nèi)容,或顯示注釋或所選框架的翻譯
動態(tài)圖和統(tǒng)計(jì)信息,用于序列特性,例如pI,分子量,熔點(diǎn),AA組成等
5、序列比對
DNA或蛋白質(zhì)的多重和成對序列比對,包括全基因組比對
與包括Aligner,MUSCLE,MAFFT,Clustal Omega,MAUVE和LastZ在內(nèi)的可信算法保持一致
使用實(shí)時(shí)翻譯和突出顯示查看和編輯路線
6、系統(tǒng)發(fā)育學(xué)
使用Geneious Prime 2021樹構(gòu)建器,MrBayes,PAUP *,PhyML,RAxML等構(gòu)建樹
可視化,編輯和標(biāo)記您的樹
交互式距離矩陣查看器
出版物質(zhì)量出口
7、微衛(wèi)星分析
導(dǎo)入原始ABI跟蹤文件
修剪,預(yù)測和手動調(diào)整峰
Bin進(jìn)入等位基因
產(chǎn)生等位基因調(diào)用的表格輸出
8、分子克隆
查看質(zhì)粒圖譜,自動注釋載體以及帶有注釋的復(fù)制粘貼序列
一步式GoldenGate(IIS類型)和限制克隆
基于同源性的克隆,包括Gibson,GeneArt和In-Fusion
TOPO克隆
克隆操作的父母/后代血統(tǒng)追蹤
密碼子優(yōu)化和反向翻譯
沉默突變分析以發(fā)現(xiàn)潛在的限制性酶切位點(diǎn)
模擬PCR,消化和連接
CRISPR站點(diǎn)查找器
9、底漆設(shè)計(jì)
自動設(shè)計(jì)針對任何目標(biāo)區(qū)域或整個(gè)序列的PCR和測序引物以及雜交探針
在序列視圖中輕松添加引物
設(shè)計(jì)基本和簡并PCR引物
在設(shè)計(jì)過程之前,之中或之后添加和刪除引物序列的延伸
引物特異性測試,以檢查模板序列上是否有其他結(jié)合位點(diǎn)
篩選物理性質(zhì),發(fā)夾和引物二聚體
以FASTA,電子表格或GenBank格式拖放引物
10、數(shù)據(jù)管理與協(xié)作
拖放導(dǎo)入文件和文件夾,包括 Vector NTI數(shù)據(jù)庫
將電子表格中的元數(shù)據(jù)導(dǎo)入序列和其他文檔
智能NGS導(dǎo)入–一步導(dǎo)入任何種類的SAM,BAM,GFF,BED和VCF文件
直觀的基于文件夾的項(xiàng)目組織
無縫集成共享數(shù)據(jù)庫
快速搜索數(shù)據(jù)庫中的所有序列和元數(shù)據(jù)
廣泛的出口選擇
11、搜索和爆炸
直接訪問NCBI公共BLAST數(shù)據(jù)庫
私人本地?cái)?shù)據(jù)庫的自定義BLAST
集成搜索外部數(shù)據(jù)庫,包括GenBank和UniProt
將序列直接上傳到GenBank
在PubMed中搜索文獻(xiàn)
針對本地或共享數(shù)據(jù)庫的高級搜索
12、工作流程
使用可視化編輯器創(chuàng)建用于自動化批量分析的工作流
超過20種內(nèi)置工作流,用于執(zhí)行管道,包括將變體應(yīng)用于參考序列,圖譜讀取然后查找SNP和隨機(jī)采樣序列
通過編寫自定義代碼工作流的選項(xiàng)擴(kuò)展功能
13、API和開發(fā)人員
使用插件開發(fā)套件添加特殊功能或與其他系統(tǒng)集成
添加您喜歡的算法,數(shù)據(jù)庫或可視化
新功能
1、分析CRISPR編輯結(jié)果
輕松對齊,聚類和可視化CRISPR編輯實(shí)驗(yàn)中的NGS讀數(shù)。通過您選擇的應(yīng)用程序(包括HDR,NHEJ和基礎(chǔ)編輯器)分析變體的頻率及其蛋白效應(yīng)。
2、增強(qiáng)型搜索選項(xiàng)
通過一個(gè)統(tǒng)一的界面快速訪問您的文檔,文件夾,分析工具和最近查看的項(xiàng)目。
3、密碼子優(yōu)化和反向翻譯改進(jìn)
2020.2 –將鼠標(biāo)懸停在優(yōu)化密碼子上,以獲取有關(guān)同義密碼子及其頻率的更多信息。
2020.1 –為模型生物定制密碼子優(yōu)化參數(shù)。
2020年–全新的密碼子優(yōu)化算法使您可以通過從蛋白質(zhì)或核苷酸序列開始生成新序列,來匹配所選生物體的密碼子用法。
4、分析CRISPR編輯結(jié)果的新工具
從CRISPR編輯實(shí)驗(yàn)的結(jié)果中比對NGS測序并使其聚類
支持各種應(yīng)用程序,包括HDR,NHEJ和基本編輯器
可視化與未突變參考序列相比的變體
分析變體的頻率及其蛋白效應(yīng)
5、增強(qiáng)的搜索界面
使用文本查詢從單個(gè)統(tǒng)一界面實(shí)時(shí)搜索文件夾和文檔
搜索Geneious Prime中可用的分析工具(操作)的新功能
輕松訪問其他高級搜索選項(xiàng)
快速訪問最近查看的文件夾和文檔
6、密碼子優(yōu)化改進(jìn)
有關(guān)優(yōu)化密碼子注釋的信息工具提示可在所選密碼子使用表中提供有關(guān)同義密碼子及其頻率的信息
現(xiàn)在,在通過選擇注釋優(yōu)化選擇的區(qū)域時(shí),將考慮包括方向性和CDS codon_start信息在內(nèi)的注釋屬性
當(dāng)以多個(gè)間隔優(yōu)化選定注釋時(shí),跨間隔優(yōu)化選擇,并且允許密碼子跨越相鄰間隔
當(dāng)優(yōu)化反向選擇區(qū)域時(shí),反向互補(bǔ)序列現(xiàn)在已優(yōu)化
配置要求
Windows 7、8、8.1和10。請注意,Geneious Prime 2020及更高版本不支持32位Windows
注意:Windows不支持以下插件:TopHat,Velvet Optimiser
注意:使用Spades和Flye插件需要Windows 10以及用于Linux的Windows子系統(tǒng)
標(biāo)簽: 生物科研 生物信息學(xué)分析
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