UCSF Chimera是一款免費(fèi)的分子結(jié)構(gòu)和相關(guān)數(shù)據(jù)的分析程序，此工具能夠?qū)Ψ肿用芏葓D、軌跡和序列排序。軟件中還內(nèi)置了豐富的功能，可幫助用戶更方便的進(jìn)行數(shù)據(jù)的分析和模擬。軟件功能強(qiáng)大，有著簡潔的使用界面，支持生成圖像和動(dòng)畫，使用起來簡單方便。

軟件功能

1、強(qiáng)大的軸、平面和質(zhì)心功能，軸可以表示為圓柱體，平面表示為圓盤，質(zhì)心表示為球體，這些都可以用于距離和角度測量。

2、體積數(shù)據(jù):可以顯示三維電子和光學(xué)顯微鏡數(shù)據(jù)、x射線密度圖、靜電勢和其他體積數(shù)據(jù)。

3、b因子著色:可以對(duì)結(jié)構(gòu)著色以顯示屬性值

4、篩選分子對(duì)接

5、通過保護(hù)著色

6、卷平面顯示

7、旋轉(zhuǎn)異構(gòu)體

使用說明

1、通過點(diǎn)擊或雙擊嵌合體圖標(biāo)(取決于它的位置)來啟動(dòng)嵌合體。通常，這個(gè)圖標(biāo)將出現(xiàn)在桌面上。Cimela可執(zhí)行文件也可以從其安裝位置運(yùn)行。

2、將出現(xiàn)一個(gè)飛濺屏幕，在幾秒鐘內(nèi)由包含圖形顯示或最近使用的文件的快速訪問列表的主嵌合體窗口替換(這并不重要，因?yàn)榇蜷_一個(gè)結(jié)構(gòu)將自動(dòng)將顯示器切換到圖形窗口)。如果你喜歡，通過點(diǎn)擊并拖動(dòng)右下角來放大窗口。窗口也可以通過點(diǎn)擊它的頂部欄和拖動(dòng)來移動(dòng)。

3、打開結(jié)構(gòu)

4、現(xiàn)在打開一個(gè)結(jié)構(gòu)。從菜單中選擇文件ID ID獲取，并將1ZIK作為結(jié)構(gòu)的ID從PDB中取出。該結(jié)構(gòu)將出現(xiàn)在圖形窗口中，它是由兩個(gè)肽形成的亮氨酸拉鏈。

5、默認(rèn)的初始顯示是色帶。也顯示原子：

6、這顯示了結(jié)構(gòu)中的所有原子和鍵，除了肽鏈中的那些被絲帶顯示抑制。下面討論如何顯示用于顯示、著色等結(jié)構(gòu)的特定部分。最初，雜原子(碳以外的原子)由元素組成：氧原子、氮原子、藍(lán)色等。碳保持模型顏色，在這種情況下是棕褐色。

7、隱藏緞帶，露出骨架原子，然后再次展示緞帶